La iglesia de San Nicolás, situada en el Casco Viejo de Bilbao junto al Arenal y frente al teatro Arriaga, tiene su origen en una antigua ermita documentada desde al menos 1463 en el barrio de pescadores, motivo por el que está dedicada a San Nicolás de Bari.

Convertida hacia 1490 en la cuarta parroquia de la villa, sufrió diversos deterioros e inundaciones, especialmente en 1553, hasta que en 1743 se derribó el edificio anterior tras constatarse su estado ruinoso.

La iglesia actual se terminó en 1756, aunque posteriormente atravesó nuevos episodios difíciles, como su cierre durante la Guerra de la Independencia, la caída de un rayo en 1816 y su uso como almacén militar en las guerras carlistas. El templo, de estilo barroco, presenta planta centralizada de cruz griega inscrita en un cuadrado, cubierta con cúpula octogonal, fachada simétrica y dos torres.

Destacan sus retablos barroco-rococó, diseñados por Diego Martínez de Arce y realizados por Juan de Aguirre y Juan de Iturburu, con esculturas de Juan Pascual de Mena y policromía de José López Perella. A lo largo del tiempo se añadieron nuevas dependencias, como la casa cural, el Comulgatorio de Julio Saracíbar y la ampliación de la sacristía por José María Basterra. La portada fue reformada en 1891 con un tímpano de bronce de Josep Llimona, y entre 2007 y 2011 se restauraron los cuatro retablos menores.