Jatorrizko higiezinak, Severino Achúcarrok (1841-1910) eginak, 50.000 m2 baino gehiagoko lursaila hartzen zuen Ramon y Cajal kalearen eta egungo Madariaga etorbidearen artean. Lau solairuko txaleta zen, hipodromo txiki batekin, baso eta lorategiz inguratua.

Ybarra familia zen egoitza horren jabea. Deustuko elizate zaharrean zegoen, XIX. mende amaierako burgesia bilbotarrak familia bakarreko etxebizitzetarako aukeratutako eremuan.

1930eko hamarkadan ondoko eraikina eraiki zen eta eskailera nagusia kendu zen. 1936an, Eusko Jaurlaritzak gerrako zaurituentzako ospitale bihurtu zuen Bidarte. Gerra Zibilaren ondoren, Klinika gisa osasun-erabilera izaten jarraitu zuen uztailaren 18an, 1984an utzi zioten arte. Ondoren, aldi baterako okupatu zuten, eta horrek narriadura bizkortu zuen, eta sute bat suntsitzeko zorian egon zen.

Bidarte jauregia 1998an berreskuratu zen, Deustuko Udal Zentro bihurtu zenean. 2002ko handitzeak zaharberritzea amaitu zuen. Gainera, Eusko Jaurlaritzaren Interes Artistikoko Ondare Arkitektonikoaren Inbentarioan sartuta dago, eta, beraz, mantendu eta kontserbatu egin behar da.